Mamy przyjemność zaprezentować pierwszą publikację związaną z projektem ECOPOND:
Annette Taugbøl, Kim Magnus Bærum, Børre K. Dervo, Frode Fossøy, ‘The first detection of the fungal pathogen batrachochytrium dendrobatidis in Norway with no evidence of population declines for great crested and smooth newts based on modeling on traditional trapping data’ Environmental DNA. 2021;00:1–9. doi.org/10.1002/edn3.180
Annette Taugbøl, jeden z głównych naukowców w projekcie ECOPOND (reprezentująca NINA, Norwegia) i lider WP2 projektu: Środowiskowe DNA (tak zwane eDNA) to całe to DNA, które unosi się w środowisku, pozostawiane przez gatunki żyjące na danym obszarze lub w jego pobliżu. W niniejszej pracy przebadaliśmy eDNA z licznych przefiltrowanych próbek wody z rejonu Oslofjorden, wykorzystując to jako metodę wykrywania populacji traszki grzebieniastej i traszki zwyczajnej oraz ich ewentualnych liczebności . Dodatkowo badaliśmy próbki pod kątem obecności inwazyjnych grzybów patogenicznych (Batrachytrium dendrobatidis, dalej zwane Bd), które stanowią przyczynę spadku liczebności populacji i wymierania rozmaitych gatunków płazów. Wykryliśmy Bd w pięciu zbiornikach wodnych po wschodniej stronie fiordu, jednak porównując wyniki z danymi uzyskanymi przy wcześniejszych, sięgających 2013 roku poborach próbek w tym obszarze, nie znaleźliśmy dowodów na spadek liczebności populacji w zainfekowanych stawach. Przyczyny takiego stanu rzeczy mogą być rozmaite. Wyjaśnienie może stanowić fakt, że traszki nie są podatne na negatywne działanie infekcji Bd. Możliwe jest również, że grzyb nie występował w stawach przez wystarczająco długi czas, a jego stężenia są jeszcze zbyt niskie, aby mogły wywołać znaczące negatywne konsekwencje.
(a) Mapa pokazuje rozmieszczenie na terenie Norwegii 31 punktów poboru próbek zaznaczonych na czarno (stawy Bd-ujemne) i na pomarańczowo (stawy Bd-dodatnie)
(b) Z każdego stawu pobrano najpierw za pomocą zlewki 15 L wody z 15 punktów pobierania próbek, a następnie z partii 15 L przefiltrowano dwie próbki o objętości 0,5 L. Obszar pobierania próbek wody w stawie odpowiadał obszarowi, który był monitorowany w celu uzyskania danych dotyczących odłowu za pomocą pułapek.
(c) DNA jest ekstrahowane z próby i analizowane metodą ddPCR. Jeżeli docelowe DNA jest obecne, zistaje amplifikowane przy użyciu starterów, a wynikiem reakcji są trzy lub więcej krople emulsji zawierającej DNA potrzebne do analizy ilościowej metodą ddPCR.
Badania naukowe prowadzące do osiągnięcia tych wyników zostały sfinansowane ze środków Environment Agency, the County Governor of Oslo and Akershus (ID 17010567) oraz Norweskiego Mechanizmu Finansowego na lata 2014 – 2021, Projekt nr 2019/34/H/NZ8/00683 (ECOPOND).